Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRA5P31644 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRA5P31644 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRA5P31644 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRA5P31644 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA5P31644 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA5P31644 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA5P31644 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA5P31644 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA5P31644 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA5P31644 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRA5P31644 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRA5P31644 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRA5P31644 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRA5P31644 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRA5P31644 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRA5P31644 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRA5P31644 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRA5P31644 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRA5P31644 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRA5P31644 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRA5P31644 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRA5P31644 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRA5P31644 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRA5P31644 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRA5P31644 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRA5P31644 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRA5P31644 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRA5P31644 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRA5P31644 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRA5P31644 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRA5P31644 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRA5P31644 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRA5P31644 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRA5P31644 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRA5P31644 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRA5P31644 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRA5P31644 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRA5P31644 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRA5P31644 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRA5P31644 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRA5P31644 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRA5P31644 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRA5P31644 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRA5P31644 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRA5P31644 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRA5P31644 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRA5P31644 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRA5P31644 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRA5P31644 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRA5P31644 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRA5P31644 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRA5P31644 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRA5P31644 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRA5P31644 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRA5P31644 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRA5P31644 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRA5P31644 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRA5P31644 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRA5P31644 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRA5P31644 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRA5P31644 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRA5P31644 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRA5P31644 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRA5P31644 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRA5P31644 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRA5P31644 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRA5P31644 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRA5P31644 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRA5P31644 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRA5P31644 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRA5P31644 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRA5P31644 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA5P31644 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA5P31644 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA5P31644 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA5P31644 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA5P31644 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA5P31644 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRA5P31644 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRA5P31644 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRA5P31644 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRA5P31644 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRA5P31644 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA5P31644 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA5P31644 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA5P31644 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA5P31644 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA5P31644 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRA5P31644 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRA5P31644 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRA5P31644 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRA5P31644 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRA5P31644 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRA5P31644 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRA5P31644 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.9 ms