Protein–RNA interactions for Protein: P30041

PRDX6, Peroxiredoxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX6P30041 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDX6P30041 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDX6P30041 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDX6P30041 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDX6P30041 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDX6P30041 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDX6P30041 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDX6P30041 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDX6P30041 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDX6P30041 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDX6P30041 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDX6P30041 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDX6P30041 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDX6P30041 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDX6P30041 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDX6P30041 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDX6P30041 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDX6P30041 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDX6P30041 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDX6P30041 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDX6P30041 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDX6P30041 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDX6P30041 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDX6P30041 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDX6P30041 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDX6P30041 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDX6P30041 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDX6P30041 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDX6P30041 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDX6P30041 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDX6P30041 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRDX6P30041 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDX6P30041 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDX6P30041 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDX6P30041 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDX6P30041 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDX6P30041 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDX6P30041 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDX6P30041 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDX6P30041 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDX6P30041 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDX6P30041 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDX6P30041 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDX6P30041 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDX6P30041 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDX6P30041 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDX6P30041 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDX6P30041 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDX6P30041 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDX6P30041 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRDX6P30041 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDX6P30041 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDX6P30041 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDX6P30041 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDX6P30041 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDX6P30041 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDX6P30041 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDX6P30041 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDX6P30041 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDX6P30041 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDX6P30041 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDX6P30041 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDX6P30041 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDX6P30041 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDX6P30041 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDX6P30041 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDX6P30041 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDX6P30041 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDX6P30041 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDX6P30041 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDX6P30041 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDX6P30041 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDX6P30041 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDX6P30041 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDX6P30041 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDX6P30041 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDX6P30041 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDX6P30041 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDX6P30041 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDX6P30041 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDX6P30041 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDX6P30041 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDX6P30041 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDX6P30041 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDX6P30041 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDX6P30041 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDX6P30041 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDX6P30041 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDX6P30041 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDX6P30041 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDX6P30041 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDX6P30041 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDX6P30041 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDX6P30041 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDX6P30041 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDX6P30041 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDX6P30041 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDX6P30041 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDX6P30041 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDX6P30041 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms