Protein–RNA interactions for Protein: P27352

GIF, Gastric intrinsic factor, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIFP27352 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GIFP27352 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIFP27352 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIFP27352 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIFP27352 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIFP27352 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIFP27352 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIFP27352 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIFP27352 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIFP27352 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIFP27352 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIFP27352 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIFP27352 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIFP27352 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIFP27352 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIFP27352 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIFP27352 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIFP27352 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GIFP27352 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GIFP27352 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GIFP27352 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GIFP27352 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIFP27352 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIFP27352 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIFP27352 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIFP27352 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIFP27352 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GIFP27352 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIFP27352 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIFP27352 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GIFP27352 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GIFP27352 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GIFP27352 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIFP27352 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIFP27352 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIFP27352 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIFP27352 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIFP27352 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIFP27352 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIFP27352 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GIFP27352 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GIFP27352 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GIFP27352 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIFP27352 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GIFP27352 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIFP27352 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIFP27352 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIFP27352 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIFP27352 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIFP27352 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIFP27352 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIFP27352 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIFP27352 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIFP27352 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GIFP27352 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIFP27352 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GIFP27352 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GIFP27352 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GIFP27352 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GIFP27352 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIFP27352 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIFP27352 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIFP27352 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GIFP27352 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GIFP27352 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIFP27352 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIFP27352 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GIFP27352 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIFP27352 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIFP27352 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIFP27352 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GIFP27352 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIFP27352 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIFP27352 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIFP27352 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIFP27352 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIFP27352 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIFP27352 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIFP27352 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GIFP27352 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GIFP27352 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GIFP27352 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIFP27352 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIFP27352 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIFP27352 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GIFP27352 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIFP27352 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIFP27352 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIFP27352 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIFP27352 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIFP27352 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIFP27352 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIFP27352 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIFP27352 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIFP27352 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIFP27352 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIFP27352 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GIFP27352 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIFP27352 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIFP27352 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms