Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLNP26678 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLNP26678 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLNP26678 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLNP26678 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLNP26678 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLNP26678 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLNP26678 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLNP26678 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLNP26678 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLNP26678 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLNP26678 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLNP26678 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLNP26678 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLNP26678 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLNP26678 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLNP26678 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLNP26678 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLNP26678 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLNP26678 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLNP26678 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLNP26678 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLNP26678 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLNP26678 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLNP26678 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PLNP26678 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLNP26678 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLNP26678 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLNP26678 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLNP26678 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLNP26678 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLNP26678 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PLNP26678 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLNP26678 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLNP26678 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLNP26678 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLNP26678 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLNP26678 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLNP26678 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLNP26678 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLNP26678 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLNP26678 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLNP26678 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLNP26678 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLNP26678 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PLNP26678 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLNP26678 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLNP26678 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLNP26678 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLNP26678 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLNP26678 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLNP26678 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLNP26678 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLNP26678 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLNP26678 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLNP26678 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLNP26678 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLNP26678 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLNP26678 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLNP26678 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLNP26678 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLNP26678 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLNP26678 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLNP26678 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLNP26678 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLNP26678 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLNP26678 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PLNP26678 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLNP26678 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLNP26678 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLNP26678 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLNP26678 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLNP26678 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLNP26678 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLNP26678 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLNP26678 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLNP26678 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLNP26678 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLNP26678 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLNP26678 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLNP26678 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLNP26678 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLNP26678 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLNP26678 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLNP26678 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLNP26678 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLNP26678 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLNP26678 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLNP26678 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLNP26678 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLNP26678 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLNP26678 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLNP26678 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLNP26678 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLNP26678 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLNP26678 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLNP26678 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLNP26678 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLNP26678 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLNP26678 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms