Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CHMLP26374 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CHMLP26374 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CHMLP26374 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CHMLP26374 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CHMLP26374 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CHMLP26374 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CHMLP26374 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CHMLP26374 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CHMLP26374 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CHMLP26374 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CHMLP26374 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CHMLP26374 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CHMLP26374 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CHMLP26374 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CHMLP26374 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CHMLP26374 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CHMLP26374 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CHMLP26374 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHMLP26374 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHMLP26374 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHMLP26374 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CHMLP26374 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CHMLP26374 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CHMLP26374 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CHMLP26374 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHMLP26374 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHMLP26374 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHMLP26374 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHMLP26374 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
CHMLP26374 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHMLP26374 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHMLP26374 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHMLP26374 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHMLP26374 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHMLP26374 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CHMLP26374 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CHMLP26374 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CHMLP26374 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CHMLP26374 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHMLP26374 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHMLP26374 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHMLP26374 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHMLP26374 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHMLP26374 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CHMLP26374 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CHMLP26374 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CHMLP26374 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHMLP26374 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHMLP26374 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHMLP26374 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHMLP26374 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CHMLP26374 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CHMLP26374 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
CHMLP26374 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CHMLP26374 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CHMLP26374 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CHMLP26374 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CHMLP26374 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CHMLP26374 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CHMLP26374 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CHMLP26374 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CHMLP26374 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CHMLP26374 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CHMLP26374 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CHMLP26374 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CHMLP26374 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CHMLP26374 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHMLP26374 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHMLP26374 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CHMLP26374 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHMLP26374 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHMLP26374 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHMLP26374 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHMLP26374 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHMLP26374 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CHMLP26374 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CHMLP26374 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CHMLP26374 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CHMLP26374 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHMLP26374 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHMLP26374 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CHMLP26374 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHMLP26374 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHMLP26374 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHMLP26374 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHMLP26374 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHMLP26374 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHMLP26374 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHMLP26374 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CHMLP26374 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CHMLP26374 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CHMLP26374 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CHMLP26374 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CHMLP26374 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CHMLP26374 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CHMLP26374 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CHMLP26374 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CHMLP26374 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CHMLP26374 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms