Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRDP23468 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRDP23468 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRDP23468 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRDP23468 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRDP23468 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRDP23468 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRDP23468 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRDP23468 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRDP23468 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRDP23468 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRDP23468 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRDP23468 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRDP23468 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRDP23468 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRDP23468 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRDP23468 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRDP23468 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRDP23468 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRDP23468 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRDP23468 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRDP23468 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRDP23468 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRDP23468 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRDP23468 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRDP23468 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRDP23468 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRDP23468 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRDP23468 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRDP23468 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRDP23468 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRDP23468 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRDP23468 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRDP23468 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRDP23468 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRDP23468 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRDP23468 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRDP23468 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRDP23468 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRDP23468 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRDP23468 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRDP23468 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRDP23468 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRDP23468 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRDP23468 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRDP23468 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRDP23468 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRDP23468 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRDP23468 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRDP23468 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRDP23468 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRDP23468 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRDP23468 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRDP23468 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRDP23468 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRDP23468 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRDP23468 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRDP23468 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRDP23468 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRDP23468 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRDP23468 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRDP23468 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRDP23468 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRDP23468 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRDP23468 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRDP23468 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRDP23468 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRDP23468 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRDP23468 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRDP23468 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRDP23468 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRDP23468 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRDP23468 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRDP23468 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRDP23468 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRDP23468 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRDP23468 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRDP23468 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRDP23468 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRDP23468 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRDP23468 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRDP23468 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRDP23468 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRDP23468 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRDP23468 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRDP23468 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRDP23468 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRDP23468 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRDP23468 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRDP23468 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRDP23468 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRDP23468 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRDP23468 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRDP23468 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PTPRDP23468 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PTPRDP23468 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
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