Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRBP23467 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRBP23467 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRBP23467 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRBP23467 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRBP23467 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRBP23467 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRBP23467 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRBP23467 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRBP23467 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRBP23467 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRBP23467 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRBP23467 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRBP23467 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRBP23467 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRBP23467 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRBP23467 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRBP23467 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRBP23467 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRBP23467 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRBP23467 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRBP23467 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRBP23467 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRBP23467 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRBP23467 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRBP23467 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRBP23467 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRBP23467 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRBP23467 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRBP23467 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRBP23467 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRBP23467 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRBP23467 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRBP23467 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRBP23467 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRBP23467 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPRBP23467 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPRBP23467 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRBP23467 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRBP23467 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRBP23467 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRBP23467 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRBP23467 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRBP23467 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRBP23467 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRBP23467 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRBP23467 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRBP23467 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRBP23467 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRBP23467 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRBP23467 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRBP23467 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRBP23467 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRBP23467 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRBP23467 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRBP23467 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRBP23467 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRBP23467 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRBP23467 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRBP23467 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRBP23467 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRBP23467 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRBP23467 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRBP23467 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRBP23467 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRBP23467 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRBP23467 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRBP23467 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRBP23467 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRBP23467 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRBP23467 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRBP23467 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRBP23467 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
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