Protein–RNA interactions for Protein: P18505

GABRB1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB1P18505 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRB1P18505 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRB1P18505 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRB1P18505 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRB1P18505 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRB1P18505 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRB1P18505 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRB1P18505 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRB1P18505 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRB1P18505 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRB1P18505 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRB1P18505 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRB1P18505 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRB1P18505 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRB1P18505 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRB1P18505 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRB1P18505 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRB1P18505 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRB1P18505 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRB1P18505 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRB1P18505 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRB1P18505 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRB1P18505 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRB1P18505 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB1P18505 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB1P18505 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB1P18505 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB1P18505 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB1P18505 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRB1P18505 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRB1P18505 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRB1P18505 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRB1P18505 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GABRB1P18505 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GABRB1P18505 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRB1P18505 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRB1P18505 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRB1P18505 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRB1P18505 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRB1P18505 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRB1P18505 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRB1P18505 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRB1P18505 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRB1P18505 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRB1P18505 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRB1P18505 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRB1P18505 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRB1P18505 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRB1P18505 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRB1P18505 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRB1P18505 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRB1P18505 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRB1P18505 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRB1P18505 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABRB1P18505 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABRB1P18505 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABRB1P18505 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABRB1P18505 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRB1P18505 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRB1P18505 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRB1P18505 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRB1P18505 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRB1P18505 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRB1P18505 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRB1P18505 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRB1P18505 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRB1P18505 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRB1P18505 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRB1P18505 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRB1P18505 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRB1P18505 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRB1P18505 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRB1P18505 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRB1P18505 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRB1P18505 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRB1P18505 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRB1P18505 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRB1P18505 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRB1P18505 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRB1P18505 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRB1P18505 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRB1P18505 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRB1P18505 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRB1P18505 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRB1P18505 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRB1P18505 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRB1P18505 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRB1P18505 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRB1P18505 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRB1P18505 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRB1P18505 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRB1P18505 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRB1P18505 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRB1P18505 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRB1P18505 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRB1P18505 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRB1P18505 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRB1P18505 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRB1P18505 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRB1P18505 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms