Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GM2AP17900 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GM2AP17900 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GM2AP17900 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GM2AP17900 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GM2AP17900 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GM2AP17900 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GM2AP17900 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GM2AP17900 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GM2AP17900 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GM2AP17900 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GM2AP17900 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GM2AP17900 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GM2AP17900 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GM2AP17900 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GM2AP17900 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GM2AP17900 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GM2AP17900 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GM2AP17900 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GM2AP17900 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GM2AP17900 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GM2AP17900 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GM2AP17900 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GM2AP17900 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GM2AP17900 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GM2AP17900 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GM2AP17900 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GM2AP17900 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GM2AP17900 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GM2AP17900 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GM2AP17900 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GM2AP17900 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GM2AP17900 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GM2AP17900 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GM2AP17900 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GM2AP17900 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GM2AP17900 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GM2AP17900 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GM2AP17900 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GM2AP17900 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GM2AP17900 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GM2AP17900 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GM2AP17900 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GM2AP17900 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GM2AP17900 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GM2AP17900 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GM2AP17900 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GM2AP17900 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GM2AP17900 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GM2AP17900 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GM2AP17900 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GM2AP17900 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GM2AP17900 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GM2AP17900 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GM2AP17900 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GM2AP17900 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GM2AP17900 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GM2AP17900 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GM2AP17900 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GM2AP17900 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GM2AP17900 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GM2AP17900 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GM2AP17900 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GM2AP17900 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GM2AP17900 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GM2AP17900 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GM2AP17900 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GM2AP17900 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GM2AP17900 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GM2AP17900 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GM2AP17900 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GM2AP17900 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GM2AP17900 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GM2AP17900 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GM2AP17900 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GM2AP17900 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GM2AP17900 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GM2AP17900 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GM2AP17900 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GM2AP17900 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GM2AP17900 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GM2AP17900 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GM2AP17900 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GM2AP17900 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GM2AP17900 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GM2AP17900 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GM2AP17900 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GM2AP17900 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GM2AP17900 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GM2AP17900 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GM2AP17900 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GM2AP17900 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GM2AP17900 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GM2AP17900 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GM2AP17900 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GM2AP17900 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GM2AP17900 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GM2AP17900 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GM2AP17900 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GM2AP17900 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms