Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
XBP1P17861 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
XBP1P17861 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
XBP1P17861 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
XBP1P17861 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
XBP1P17861 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
XBP1P17861 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
XBP1P17861 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
XBP1P17861 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
XBP1P17861 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
XBP1P17861 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
XBP1P17861 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
XBP1P17861 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
XBP1P17861 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
XBP1P17861 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
XBP1P17861 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
XBP1P17861 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
XBP1P17861 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
XBP1P17861 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
XBP1P17861 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
XBP1P17861 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
XBP1P17861 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
XBP1P17861 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
XBP1P17861 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
XBP1P17861 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
XBP1P17861 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
XBP1P17861 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
XBP1P17861 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
XBP1P17861 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
XBP1P17861 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
XBP1P17861 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
XBP1P17861 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
XBP1P17861 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
XBP1P17861 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
XBP1P17861 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
XBP1P17861 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
XBP1P17861 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
XBP1P17861 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
XBP1P17861 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
XBP1P17861 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
XBP1P17861 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
XBP1P17861 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
XBP1P17861 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
XBP1P17861 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
XBP1P17861 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
XBP1P17861 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
XBP1P17861 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
XBP1P17861 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
XBP1P17861 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
XBP1P17861 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
XBP1P17861 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
XBP1P17861 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
XBP1P17861 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
XBP1P17861 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
XBP1P17861 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
XBP1P17861 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
XBP1P17861 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
XBP1P17861 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
XBP1P17861 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
XBP1P17861 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
XBP1P17861 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
XBP1P17861 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
XBP1P17861 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
XBP1P17861 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
XBP1P17861 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
XBP1P17861 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
XBP1P17861 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
XBP1P17861 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
XBP1P17861 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
XBP1P17861 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
XBP1P17861 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
XBP1P17861 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
XBP1P17861 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
XBP1P17861 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
XBP1P17861 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
XBP1P17861 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
XBP1P17861 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
XBP1P17861 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
XBP1P17861 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
XBP1P17861 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
XBP1P17861 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
XBP1P17861 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
XBP1P17861 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
XBP1P17861 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
XBP1P17861 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
XBP1P17861 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
XBP1P17861 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
XBP1P17861 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
XBP1P17861 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
XBP1P17861 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
XBP1P17861 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
XBP1P17861 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
XBP1P17861 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
XBP1P17861 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
XBP1P17861 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
XBP1P17861 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
XBP1P17861 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
XBP1P17861 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
XBP1P17861 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
XBP1P17861 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms