Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
KCNA6P17658 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
KCNA6P17658 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
KCNA6P17658 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
KCNA6P17658 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
KCNA6P17658 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
KCNA6P17658 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
KCNA6P17658 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
KCNA6P17658 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
KCNA6P17658 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
KCNA6P17658 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
KCNA6P17658 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
KCNA6P17658 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
KCNA6P17658 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
KCNA6P17658 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
KCNA6P17658 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
KCNA6P17658 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
KCNA6P17658 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
KCNA6P17658 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
KCNA6P17658 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
KCNA6P17658 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
KCNA6P17658 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
KCNA6P17658 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
KCNA6P17658 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
KCNA6P17658 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
KCNA6P17658 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
KCNA6P17658 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
KCNA6P17658 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
KCNA6P17658 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
KCNA6P17658 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
KCNA6P17658 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
KCNA6P17658 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
KCNA6P17658 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
KCNA6P17658 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
KCNA6P17658 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
KCNA6P17658 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
KCNA6P17658 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
KCNA6P17658 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
KCNA6P17658 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
KCNA6P17658 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
KCNA6P17658 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
KCNA6P17658 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
KCNA6P17658 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
KCNA6P17658 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
KCNA6P17658 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
KCNA6P17658 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
KCNA6P17658 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
KCNA6P17658 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
KCNA6P17658 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
KCNA6P17658 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
KCNA6P17658 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
KCNA6P17658 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
KCNA6P17658 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
KCNA6P17658 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
KCNA6P17658 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
KCNA6P17658 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
KCNA6P17658 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
KCNA6P17658 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
KCNA6P17658 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
KCNA6P17658 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
KCNA6P17658 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
KCNA6P17658 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
KCNA6P17658 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
KCNA6P17658 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
KCNA6P17658 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
KCNA6P17658 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
KCNA6P17658 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
KCNA6P17658 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
KCNA6P17658 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
KCNA6P17658 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
KCNA6P17658 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
KCNA6P17658 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
KCNA6P17658 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
KCNA6P17658 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
KCNA6P17658 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
KCNA6P17658 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
KCNA6P17658 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
KCNA6P17658 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
KCNA6P17658 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
KCNA6P17658 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
KCNA6P17658 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
KCNA6P17658 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
KCNA6P17658 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
KCNA6P17658 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
KCNA6P17658 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
KCNA6P17658 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
KCNA6P17658 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms