Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATF7P17544 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATF7P17544 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATF7P17544 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF7P17544 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF7P17544 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATF7P17544 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATF7P17544 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATF7P17544 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF7P17544 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF7P17544 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF7P17544 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATF7P17544 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.2
ATF7P17544 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATF7P17544 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATF7P17544 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF7P17544 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF7P17544 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF7P17544 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF7P17544 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF7P17544 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF7P17544 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF7P17544 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF7P17544 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF7P17544 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF7P17544 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF7P17544 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ATF7P17544 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATF7P17544 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATF7P17544 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATF7P17544 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATF7P17544 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATF7P17544 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF7P17544 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF7P17544 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF7P17544 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF7P17544 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATF7P17544 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATF7P17544 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATF7P17544 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATF7P17544 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ATF7P17544 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF7P17544 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF7P17544 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATF7P17544 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATF7P17544 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ATF7P17544 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ATF7P17544 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ATF7P17544 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ATF7P17544 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ATF7P17544 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATF7P17544 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ATF7P17544 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATF7P17544 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATF7P17544 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATF7P17544 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATF7P17544 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATF7P17544 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATF7P17544 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ATF7P17544 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATF7P17544 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATF7P17544 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATF7P17544 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ATF7P17544 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATF7P17544 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATF7P17544 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATF7P17544 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATF7P17544 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATF7P17544 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATF7P17544 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATF7P17544 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATF7P17544 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATF7P17544 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATF7P17544 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATF7P17544 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATF7P17544 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATF7P17544 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATF7P17544 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATF7P17544 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATF7P17544 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATF7P17544 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATF7P17544 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATF7P17544 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATF7P17544 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATF7P17544 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATF7P17544 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATF7P17544 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATF7P17544 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATF7P17544 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATF7P17544 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATF7P17544 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATF7P17544 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF7P17544 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF7P17544 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF7P17544 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF7P17544 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF7P17544 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF7P17544 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF7P17544 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF7P17544 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms