Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCAP17252 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCAP17252 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCAP17252 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCAP17252 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCAP17252 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCAP17252 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCAP17252 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCAP17252 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCAP17252 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCAP17252 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCAP17252 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCAP17252 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCAP17252 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCAP17252 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCAP17252 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCAP17252 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCAP17252 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCAP17252 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCAP17252 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCAP17252 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCAP17252 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCAP17252 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCAP17252 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCAP17252 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCAP17252 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCAP17252 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCAP17252 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCAP17252 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCAP17252 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCAP17252 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCAP17252 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCAP17252 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCAP17252 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCAP17252 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKCAP17252 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCAP17252 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCAP17252 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCAP17252 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCAP17252 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCAP17252 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCAP17252 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCAP17252 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCAP17252 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCAP17252 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCAP17252 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCAP17252 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCAP17252 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCAP17252 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCAP17252 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCAP17252 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCAP17252 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCAP17252 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCAP17252 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCAP17252 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCAP17252 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCAP17252 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCAP17252 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCAP17252 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCAP17252 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCAP17252 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCAP17252 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms