Protein–RNA interactions for Protein: P15863

PAX1, Paired box protein Pax-1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX1P15863 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAX1P15863 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAX1P15863 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAX1P15863 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PAX1P15863 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAX1P15863 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAX1P15863 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAX1P15863 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAX1P15863 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAX1P15863 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAX1P15863 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAX1P15863 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PAX1P15863 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PAX1P15863 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PAX1P15863 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PAX1P15863 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PAX1P15863 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PAX1P15863 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PAX1P15863 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PAX1P15863 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PAX1P15863 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAX1P15863 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAX1P15863 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAX1P15863 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAX1P15863 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAX1P15863 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAX1P15863 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAX1P15863 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAX1P15863 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAX1P15863 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAX1P15863 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAX1P15863 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAX1P15863 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAX1P15863 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAX1P15863 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAX1P15863 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAX1P15863 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAX1P15863 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAX1P15863 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PAX1P15863 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAX1P15863 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAX1P15863 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAX1P15863 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAX1P15863 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAX1P15863 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAX1P15863 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAX1P15863 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAX1P15863 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAX1P15863 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAX1P15863 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAX1P15863 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAX1P15863 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAX1P15863 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAX1P15863 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAX1P15863 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAX1P15863 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAX1P15863 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAX1P15863 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAX1P15863 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAX1P15863 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAX1P15863 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAX1P15863 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAX1P15863 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAX1P15863 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAX1P15863 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAX1P15863 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAX1P15863 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX1P15863 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX1P15863 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAX1P15863 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAX1P15863 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAX1P15863 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAX1P15863 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PAX1P15863 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAX1P15863 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAX1P15863 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAX1P15863 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAX1P15863 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAX1P15863 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAX1P15863 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAX1P15863 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAX1P15863 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAX1P15863 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAX1P15863 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAX1P15863 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAX1P15863 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAX1P15863 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAX1P15863 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAX1P15863 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAX1P15863 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAX1P15863 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAX1P15863 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAX1P15863 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAX1P15863 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAX1P15863 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAX1P15863 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAX1P15863 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAX1P15863 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAX1P15863 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAX1P15863 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms