Protein–RNA interactions for Protein: P14854

COX6B1, Cytochrome c oxidase subunit 6B1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6B1P14854 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX6B1P14854 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX6B1P14854 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX6B1P14854 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COX6B1P14854 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX6B1P14854 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX6B1P14854 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COX6B1P14854 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX6B1P14854 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX6B1P14854 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX6B1P14854 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COX6B1P14854 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COX6B1P14854 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COX6B1P14854 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COX6B1P14854 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COX6B1P14854 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COX6B1P14854 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COX6B1P14854 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COX6B1P14854 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COX6B1P14854 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
COX6B1P14854 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COX6B1P14854 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COX6B1P14854 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COX6B1P14854 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COX6B1P14854 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COX6B1P14854 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COX6B1P14854 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COX6B1P14854 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COX6B1P14854 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COX6B1P14854 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COX6B1P14854 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COX6B1P14854 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COX6B1P14854 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COX6B1P14854 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COX6B1P14854 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COX6B1P14854 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COX6B1P14854 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COX6B1P14854 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COX6B1P14854 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COX6B1P14854 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COX6B1P14854 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COX6B1P14854 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COX6B1P14854 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COX6B1P14854 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COX6B1P14854 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COX6B1P14854 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COX6B1P14854 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COX6B1P14854 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COX6B1P14854 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COX6B1P14854 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COX6B1P14854 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COX6B1P14854 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COX6B1P14854 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COX6B1P14854 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COX6B1P14854 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COX6B1P14854 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COX6B1P14854 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COX6B1P14854 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COX6B1P14854 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COX6B1P14854 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COX6B1P14854 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COX6B1P14854 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COX6B1P14854 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COX6B1P14854 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COX6B1P14854 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COX6B1P14854 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX6B1P14854 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX6B1P14854 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX6B1P14854 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX6B1P14854 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX6B1P14854 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX6B1P14854 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX6B1P14854 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX6B1P14854 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX6B1P14854 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms