Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB2P14652 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB2P14652 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB2P14652 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB2P14652 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXB2P14652 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXB2P14652 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXB2P14652 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXB2P14652 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXB2P14652 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXB2P14652 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXB2P14652 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXB2P14652 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXB2P14652 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXB2P14652 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXB2P14652 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXB2P14652 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXB2P14652 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXB2P14652 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB2P14652 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXB2P14652 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB2P14652 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB2P14652 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB2P14652 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXB2P14652 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXB2P14652 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXB2P14652 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXB2P14652 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXB2P14652 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXB2P14652 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXB2P14652 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXB2P14652 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXB2P14652 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXB2P14652 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXB2P14652 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXB2P14652 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXB2P14652 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXB2P14652 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXB2P14652 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXB2P14652 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXB2P14652 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXB2P14652 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB2P14652 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXB2P14652 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXB2P14652 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXB2P14652 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXB2P14652 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXB2P14652 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXB2P14652 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB2P14652 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB2P14652 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB2P14652 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB2P14652 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXB2P14652 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB2P14652 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB2P14652 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB2P14652 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXB2P14652 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXB2P14652 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXB2P14652 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXB2P14652 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXB2P14652 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXB2P14652 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB2P14652 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB2P14652 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB2P14652 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB2P14652 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB2P14652 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXB2P14652 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms