Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NID1P14543 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NID1P14543 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NID1P14543 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NID1P14543 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NID1P14543 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NID1P14543 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NID1P14543 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NID1P14543 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NID1P14543 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NID1P14543 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NID1P14543 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NID1P14543 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NID1P14543 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NID1P14543 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NID1P14543 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NID1P14543 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NID1P14543 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NID1P14543 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NID1P14543 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NID1P14543 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NID1P14543 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NID1P14543 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NID1P14543 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NID1P14543 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NID1P14543 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NID1P14543 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NID1P14543 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NID1P14543 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NID1P14543 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NID1P14543 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NID1P14543 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NID1P14543 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NID1P14543 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NID1P14543 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NID1P14543 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NID1P14543 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NID1P14543 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NID1P14543 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NID1P14543 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NID1P14543 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NID1P14543 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NID1P14543 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NID1P14543 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NID1P14543 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NID1P14543 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NID1P14543 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NID1P14543 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NID1P14543 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NID1P14543 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NID1P14543 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NID1P14543 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NID1P14543 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NID1P14543 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NID1P14543 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NID1P14543 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NID1P14543 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NID1P14543 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NID1P14543 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NID1P14543 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NID1P14543 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NID1P14543 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NID1P14543 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NID1P14543 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NID1P14543 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NID1P14543 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NID1P14543 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NID1P14543 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NID1P14543 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NID1P14543 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NID1P14543 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NID1P14543 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NID1P14543 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NID1P14543 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NID1P14543 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NID1P14543 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NID1P14543 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NID1P14543 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NID1P14543 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NID1P14543 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NID1P14543 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NID1P14543 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
NID1P14543 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NID1P14543 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NID1P14543 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NID1P14543 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NID1P14543 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NID1P14543 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NID1P14543 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NID1P14543 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NID1P14543 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NID1P14543 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NID1P14543 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NID1P14543 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NID1P14543 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NID1P14543 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NID1P14543 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NID1P14543 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NID1P14543 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NID1P14543 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms