Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNT1P13805 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNT1P13805 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNT1P13805 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNT1P13805 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNT1P13805 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNT1P13805 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNT1P13805 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNT1P13805 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNT1P13805 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNNT1P13805 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNT1P13805 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNT1P13805 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNT1P13805 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNNT1P13805 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNNT1P13805 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNNT1P13805 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNT1P13805 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNT1P13805 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNT1P13805 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNT1P13805 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNNT1P13805 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNNT1P13805 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNNT1P13805 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNNT1P13805 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNNT1P13805 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNNT1P13805 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNNT1P13805 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
TNNT1P13805 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNNT1P13805 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNNT1P13805 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNNT1P13805 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNT1P13805 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNT1P13805 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNNT1P13805 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNNT1P13805 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNNT1P13805 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNNT1P13805 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNNT1P13805 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNNT1P13805 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNNT1P13805 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNNT1P13805 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNNT1P13805 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNT1P13805 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNT1P13805 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNT1P13805 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNT1P13805 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNT1P13805 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNT1P13805 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNT1P13805 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNT1P13805 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNT1P13805 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNNT1P13805 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNNT1P13805 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNT1P13805 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNT1P13805 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNT1P13805 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNT1P13805 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNNT1P13805 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNNT1P13805 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNNT1P13805 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNNT1P13805 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNNT1P13805 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNNT1P13805 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNNT1P13805 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNT1P13805 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNT1P13805 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNT1P13805 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNT1P13805 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNNT1P13805 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNNT1P13805 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNNT1P13805 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNT1P13805 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNT1P13805 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNT1P13805 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNT1P13805 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNT1P13805 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNT1P13805 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNT1P13805 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNT1P13805 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNNT1P13805 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNT1P13805 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNT1P13805 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNT1P13805 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNT1P13805 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNNT1P13805 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNNT1P13805 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNT1P13805 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNT1P13805 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNT1P13805 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNT1P13805 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNT1P13805 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNT1P13805 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNT1P13805 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNT1P13805 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNT1P13805 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNT1P13805 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNT1P13805 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNT1P13805 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNT1P13805 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms