Protein–RNA interactions for Protein: P11277

SPTB, Spectrin beta chain, erythrocytic, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBP11277 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPTBP11277 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPTBP11277 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPTBP11277 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTBP11277 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTBP11277 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPTBP11277 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPTBP11277 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPTBP11277 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPTBP11277 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPTBP11277 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPTBP11277 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPTBP11277 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPTBP11277 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPTBP11277 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPTBP11277 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SPTBP11277 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPTBP11277 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPTBP11277 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPTBP11277 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTBP11277 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTBP11277 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTBP11277 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTBP11277 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPTBP11277 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPTBP11277 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPTBP11277 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPTBP11277 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPTBP11277 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPTBP11277 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTBP11277 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTBP11277 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPTBP11277 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPTBP11277 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPTBP11277 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTBP11277 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTBP11277 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTBP11277 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTBP11277 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPTBP11277 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPTBP11277 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTBP11277 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTBP11277 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPTBP11277 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPTBP11277 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPTBP11277 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTBP11277 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTBP11277 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPTBP11277 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SPTBP11277 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPTBP11277 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPTBP11277 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPTBP11277 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPTBP11277 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPTBP11277 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPTBP11277 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTBP11277 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBP11277 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBP11277 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTBP11277 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTBP11277 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTBP11277 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTBP11277 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTBP11277 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBP11277 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBP11277 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBP11277 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBP11277 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTBP11277 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTBP11277 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTBP11277 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTBP11277 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTBP11277 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTBP11277 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTBP11277 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTBP11277 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTBP11277 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTBP11277 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTBP11277 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTBP11277 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTBP11277 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTBP11277 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTBP11277 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTBP11277 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTBP11277 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTBP11277 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTBP11277 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTBP11277 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTBP11277 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTBP11277 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTBP11277 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTBP11277 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTBP11277 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTBP11277 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTBP11277 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTBP11277 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTBP11277 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTBP11277 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTBP11277 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTBP11277 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms