Protein–RNA interactions for Protein: P0DP71

FAM236C, Protein FAM236C, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM236CP0DP71 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM236CP0DP71 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM236CP0DP71 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM236CP0DP71 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM236CP0DP71 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM236CP0DP71 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM236CP0DP71 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM236CP0DP71 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM236CP0DP71 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM236CP0DP71 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM236CP0DP71 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM236CP0DP71 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM236CP0DP71 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM236CP0DP71 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM236CP0DP71 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM236CP0DP71 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM236CP0DP71 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM236CP0DP71 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM236CP0DP71 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM236CP0DP71 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM236CP0DP71 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM236CP0DP71 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM236CP0DP71 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM236CP0DP71 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM236CP0DP71 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM236CP0DP71 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM236CP0DP71 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM236CP0DP71 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM236CP0DP71 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM236CP0DP71 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM236CP0DP71 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM236CP0DP71 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM236CP0DP71 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM236CP0DP71 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM236CP0DP71 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM236CP0DP71 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM236CP0DP71 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM236CP0DP71 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM236CP0DP71 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM236CP0DP71 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM236CP0DP71 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM236CP0DP71 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM236CP0DP71 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM236CP0DP71 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM236CP0DP71 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM236CP0DP71 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms