Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CALM3P0DP25 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CALM3P0DP25 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CALM3P0DP25 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CALM3P0DP25 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CALM3P0DP25 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CALM3P0DP25 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CALM3P0DP25 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CALM3P0DP25 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CALM3P0DP25 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CALM3P0DP25 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CALM3P0DP25 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
CALM3P0DP25 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CALM3P0DP25 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
CALM3P0DP25 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CALM3P0DP25 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CALM3P0DP25 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CALM3P0DP25 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CALM3P0DP25 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CALM3P0DP25 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CALM3P0DP25 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CALM3P0DP25 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CALM3P0DP25 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CALM3P0DP25 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CALM3P0DP25 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CALM3P0DP25 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CALM3P0DP25 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CALM3P0DP25 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CALM3P0DP25 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CALM3P0DP25 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CALM3P0DP25 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CALM3P0DP25 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CALM3P0DP25 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CALM3P0DP25 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CALM3P0DP25 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CALM3P0DP25 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CALM3P0DP25 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CALM3P0DP25 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CALM3P0DP25 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CALM3P0DP25 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CALM3P0DP25 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CALM3P0DP25 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CALM3P0DP25 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CALM3P0DP25 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CALM3P0DP25 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CALM3P0DP25 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CALM3P0DP25 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CALM3P0DP25 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CALM3P0DP25 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CALM3P0DP25 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CALM3P0DP25 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CALM3P0DP25 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CALM3P0DP25 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CALM3P0DP25 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CALM3P0DP25 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CALM3P0DP25 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CALM3P0DP25 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CALM3P0DP25 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CALM3P0DP25 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CALM3P0DP25 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CALM3P0DP25 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CALM3P0DP25 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CALM3P0DP25 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CALM3P0DP25 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CALM3P0DP25 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CALM3P0DP25 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CALM3P0DP25 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CALM3P0DP25 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CALM3P0DP25 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CALM3P0DP25 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CALM3P0DP25 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CALM3P0DP25 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CALM3P0DP25 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CALM3P0DP25 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CALM3P0DP25 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CALM3P0DP25 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CALM3P0DP25 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CALM3P0DP25 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CALM3P0DP25 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CALM3P0DP25 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CALM3P0DP25 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CALM3P0DP25 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CALM3P0DP25 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CALM3P0DP25 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CALM3P0DP25 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CALM3P0DP25 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CALM3P0DP25 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CALM3P0DP25 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CALM3P0DP25 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CALM3P0DP25 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CALM3P0DP25 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CALM3P0DP25 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CALM3P0DP25 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CALM3P0DP25 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CALM3P0DP25 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CALM3P0DP25 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CALM3P0DP25 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CALM3P0DP25 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CALM3P0DP25 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CALM3P0DP25 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms