Protein–RNA interactions for Protein: P0CG48

UBC, Polyubiquitin-C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBCP0CG48 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBCP0CG48 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBCP0CG48 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBCP0CG48 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBCP0CG48 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBCP0CG48 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBCP0CG48 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBCP0CG48 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBCP0CG48 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBCP0CG48 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBCP0CG48 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBCP0CG48 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBCP0CG48 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBCP0CG48 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBCP0CG48 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBCP0CG48 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBCP0CG48 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBCP0CG48 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBCP0CG48 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBCP0CG48 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBCP0CG48 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBCP0CG48 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBCP0CG48 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBCP0CG48 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBCP0CG48 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBCP0CG48 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBCP0CG48 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBCP0CG48 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBCP0CG48 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBCP0CG48 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBCP0CG48 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBCP0CG48 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBCP0CG48 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBCP0CG48 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBCP0CG48 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBCP0CG48 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBCP0CG48 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBCP0CG48 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBCP0CG48 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBCP0CG48 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBCP0CG48 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBCP0CG48 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBCP0CG48 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBCP0CG48 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBCP0CG48 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBCP0CG48 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBCP0CG48 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBCP0CG48 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBCP0CG48 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBCP0CG48 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBCP0CG48 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBCP0CG48 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBCP0CG48 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBCP0CG48 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBCP0CG48 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBCP0CG48 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBCP0CG48 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBCP0CG48 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBCP0CG48 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBCP0CG48 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBCP0CG48 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBCP0CG48 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBCP0CG48 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBCP0CG48 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBCP0CG48 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBCP0CG48 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
UBCP0CG48 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBCP0CG48 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBCP0CG48 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBCP0CG48 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBCP0CG48 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBCP0CG48 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBCP0CG48 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBCP0CG48 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBCP0CG48 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBCP0CG48 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBCP0CG48 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBCP0CG48 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBCP0CG48 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBCP0CG48 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBCP0CG48 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBCP0CG48 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBCP0CG48 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBCP0CG48 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBCP0CG48 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBCP0CG48 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBCP0CG48 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBCP0CG48 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBCP0CG48 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBCP0CG48 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBCP0CG48 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBCP0CG48 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBCP0CG48 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBCP0CG48 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBCP0CG48 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBCP0CG48 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBCP0CG48 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBCP0CG48 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBCP0CG48 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBCP0CG48 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms