Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN2P0C2S0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN2P0C2S0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN2P0C2S0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN2P0C2S0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN2P0C2S0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN2P0C2S0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN2P0C2S0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN2P0C2S0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN2P0C2S0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN2P0C2S0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTXN2P0C2S0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN2P0C2S0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN2P0C2S0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN2P0C2S0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTXN2P0C2S0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTXN2P0C2S0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN2P0C2S0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTXN2P0C2S0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTXN2P0C2S0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTXN2P0C2S0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTXN2P0C2S0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTXN2P0C2S0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTXN2P0C2S0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTXN2P0C2S0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTXN2P0C2S0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTXN2P0C2S0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTXN2P0C2S0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTXN2P0C2S0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTXN2P0C2S0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTXN2P0C2S0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTXN2P0C2S0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN2P0C2S0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN2P0C2S0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN2P0C2S0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN2P0C2S0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN2P0C2S0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN2P0C2S0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN2P0C2S0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTXN2P0C2S0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTXN2P0C2S0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN2P0C2S0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN2P0C2S0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN2P0C2S0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN2P0C2S0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN2P0C2S0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN2P0C2S0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CTXN2P0C2S0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTXN2P0C2S0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN2P0C2S0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN2P0C2S0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN2P0C2S0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN2P0C2S0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN2P0C2S0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN2P0C2S0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN2P0C2S0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN2P0C2S0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN2P0C2S0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN2P0C2S0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN2P0C2S0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTXN2P0C2S0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTXN2P0C2S0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTXN2P0C2S0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTXN2P0C2S0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTXN2P0C2S0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTXN2P0C2S0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN2P0C2S0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN2P0C2S0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN2P0C2S0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN2P0C2S0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN2P0C2S0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN2P0C2S0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN2P0C2S0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN2P0C2S0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN2P0C2S0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTXN2P0C2S0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN2P0C2S0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN2P0C2S0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN2P0C2S0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTXN2P0C2S0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTXN2P0C2S0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTXN2P0C2S0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTXN2P0C2S0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTXN2P0C2S0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN2P0C2S0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN2P0C2S0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN2P0C2S0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN2P0C2S0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTXN2P0C2S0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN2P0C2S0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN2P0C2S0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN2P0C2S0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN2P0C2S0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN2P0C2S0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTXN2P0C2S0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTXN2P0C2S0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN2P0C2S0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN2P0C2S0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN2P0C2S0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTXN2P0C2S0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms