Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RHOP08100 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RHOP08100 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RHOP08100 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RHOP08100 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RHOP08100 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RHOP08100 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RHOP08100 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RHOP08100 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RHOP08100 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RHOP08100 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RHOP08100 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RHOP08100 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RHOP08100 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RHOP08100 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RHOP08100 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RHOP08100 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RHOP08100 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RHOP08100 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RHOP08100 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RHOP08100 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RHOP08100 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RHOP08100 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RHOP08100 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RHOP08100 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RHOP08100 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RHOP08100 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RHOP08100 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RHOP08100 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RHOP08100 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RHOP08100 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RHOP08100 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RHOP08100 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RHOP08100 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RHOP08100 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RHOP08100 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RHOP08100 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RHOP08100 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RHOP08100 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RHOP08100 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RHOP08100 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RHOP08100 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RHOP08100 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RHOP08100 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RHOP08100 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RHOP08100 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RHOP08100 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RHOP08100 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RHOP08100 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RHOP08100 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RHOP08100 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RHOP08100 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RHOP08100 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RHOP08100 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RHOP08100 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RHOP08100 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RHOP08100 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RHOP08100 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RHOP08100 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RHOP08100 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RHOP08100 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RHOP08100 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RHOP08100 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RHOP08100 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RHOP08100 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RHOP08100 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RHOP08100 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RHOP08100 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RHOP08100 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RHOP08100 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RHOP08100 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RHOP08100 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RHOP08100 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RHOP08100 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RHOP08100 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RHOP08100 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RHOP08100 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RHOP08100 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RHOP08100 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHOP08100 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHOP08100 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHOP08100 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RHOP08100 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RHOP08100 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHOP08100 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHOP08100 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHOP08100 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RHOP08100 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RHOP08100 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RHOP08100 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RHOP08100 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHOP08100 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHOP08100 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHOP08100 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RHOP08100 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RHOP08100 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RHOP08100 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RHOP08100 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RHOP08100 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RHOP08100 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms