Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NEFMP07197 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NEFMP07197 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NEFMP07197 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
NEFMP07197 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
NEFMP07197 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NEFMP07197 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NEFMP07197 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NEFMP07197 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NEFMP07197 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NEFMP07197 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NEFMP07197 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NEFMP07197 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NEFMP07197 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
NEFMP07197 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NEFMP07197 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NEFMP07197 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NEFMP07197 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NEFMP07197 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NEFMP07197 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NEFMP07197 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NEFMP07197 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NEFMP07197 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NEFMP07197 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NEFMP07197 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
NEFMP07197 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NEFMP07197 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NEFMP07197 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NEFMP07197 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
NEFMP07197 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NEFMP07197 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NEFMP07197 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NEFMP07197 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NEFMP07197 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NEFMP07197 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NEFMP07197 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NEFMP07197 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NEFMP07197 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NEFMP07197 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NEFMP07197 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NEFMP07197 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NEFMP07197 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
NEFMP07197 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NEFMP07197 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NEFMP07197 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NEFMP07197 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NEFMP07197 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
NEFMP07197 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NEFMP07197 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NEFMP07197 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
NEFMP07197 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NEFMP07197 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NEFMP07197 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NEFMP07197 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NEFMP07197 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NEFMP07197 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NEFMP07197 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NEFMP07197 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEFMP07197 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
NEFMP07197 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEFMP07197 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NEFMP07197 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NEFMP07197 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
NEFMP07197 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NEFMP07197 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NEFMP07197 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NEFMP07197 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NEFMP07197 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEFMP07197 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEFMP07197 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEFMP07197 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NEFMP07197 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NEFMP07197 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NEFMP07197 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NEFMP07197 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NEFMP07197 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
NEFMP07197 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NEFMP07197 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NEFMP07197 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NEFMP07197 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NEFMP07197 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEFMP07197 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEFMP07197 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEFMP07197 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEFMP07197 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEFMP07197 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NEFMP07197 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NEFMP07197 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
NEFMP07197 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NEFMP07197 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NEFMP07197 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NEFMP07197 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NEFMP07197 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NEFMP07197 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NEFMP07197 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NEFMP07197 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NEFMP07197 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NEFMP07197 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NEFMP07197 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NEFMP07197 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms