Protein–RNA interactions for Protein: P04436

T-cell receptor alpha chain V region HPB-MLT (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04436 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P04436 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P04436 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P04436 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
P04436 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
P04436 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
P04436 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P04436 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P04436 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P04436 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P04436 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P04436 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
P04436 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
P04436 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P04436 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P04436 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P04436 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
P04436 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P04436 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
P04436 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P04436 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P04436 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
P04436 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P04436 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P04436 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P04436 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
P04436 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
P04436 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
P04436 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
P04436 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P04436 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P04436 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P04436 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P04436 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P04436 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
P04436 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
P04436 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
P04436 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
P04436 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P04436 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P04436 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
P04436 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
P04436 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P04436 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P04436 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
P04436 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
P04436 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
P04436 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
P04436 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P04436 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P04436 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P04436 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P04436 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
P04436 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
P04436 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
P04436 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
P04436 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P04436 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
P04436 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P04436 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P04436 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P04436 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P04436 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
P04436 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
P04436 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
P04436 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
P04436 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
P04436 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P04436 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P04436 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P04436 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P04436 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
P04436 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P04436 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P04436 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P04436 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
P04436 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P04436 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P04436 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P04436 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
P04436 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P04436 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
P04436 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P04436 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P04436 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
P04436 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P04436 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P04436 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
P04436 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
P04436 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
P04436 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
P04436 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
P04436 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
P04436 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P04436 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P04436 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P04436 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P04436 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
P04436 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P04436 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms