Protein–RNA interactions for Protein: P01583

IL1A, Interleukin-1 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1AP01583 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IL1AP01583 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IL1AP01583 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IL1AP01583 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IL1AP01583 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IL1AP01583 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IL1AP01583 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IL1AP01583 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IL1AP01583 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IL1AP01583 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IL1AP01583 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IL1AP01583 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IL1AP01583 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IL1AP01583 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IL1AP01583 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IL1AP01583 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IL1AP01583 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IL1AP01583 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IL1AP01583 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IL1AP01583 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IL1AP01583 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IL1AP01583 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IL1AP01583 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IL1AP01583 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IL1AP01583 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IL1AP01583 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IL1AP01583 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IL1AP01583 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IL1AP01583 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IL1AP01583 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IL1AP01583 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IL1AP01583 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IL1AP01583 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IL1AP01583 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IL1AP01583 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IL1AP01583 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IL1AP01583 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IL1AP01583 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IL1AP01583 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IL1AP01583 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IL1AP01583 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IL1AP01583 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IL1AP01583 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IL1AP01583 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IL1AP01583 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IL1AP01583 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IL1AP01583 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IL1AP01583 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IL1AP01583 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IL1AP01583 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IL1AP01583 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IL1AP01583 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IL1AP01583 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IL1AP01583 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IL1AP01583 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IL1AP01583 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IL1AP01583 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IL1AP01583 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IL1AP01583 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IL1AP01583 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IL1AP01583 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IL1AP01583 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IL1AP01583 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IL1AP01583 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IL1AP01583 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IL1AP01583 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IL1AP01583 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IL1AP01583 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IL1AP01583 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IL1AP01583 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IL1AP01583 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IL1AP01583 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IL1AP01583 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IL1AP01583 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IL1AP01583 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IL1AP01583 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IL1AP01583 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IL1AP01583 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IL1AP01583 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IL1AP01583 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IL1AP01583 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IL1AP01583 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IL1AP01583 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IL1AP01583 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IL1AP01583 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IL1AP01583 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IL1AP01583 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IL1AP01583 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IL1AP01583 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IL1AP01583 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IL1AP01583 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IL1AP01583 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IL1AP01583 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IL1AP01583 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IL1AP01583 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IL1AP01583 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IL1AP01583 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IL1AP01583 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IL1AP01583 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IL1AP01583 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms