Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SERPINC1P01008 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SERPINC1P01008 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SERPINC1P01008 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SERPINC1P01008 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SERPINC1P01008 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SERPINC1P01008 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SERPINC1P01008 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SERPINC1P01008 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SERPINC1P01008 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SERPINC1P01008 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SERPINC1P01008 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SERPINC1P01008 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SERPINC1P01008 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SERPINC1P01008 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SERPINC1P01008 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SERPINC1P01008 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SERPINC1P01008 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SERPINC1P01008 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SERPINC1P01008 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SERPINC1P01008 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SERPINC1P01008 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SERPINC1P01008 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SERPINC1P01008 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SERPINC1P01008 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SERPINC1P01008 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SERPINC1P01008 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SERPINC1P01008 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SERPINC1P01008 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SERPINC1P01008 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SERPINC1P01008 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SERPINC1P01008 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SERPINC1P01008 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SERPINC1P01008 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SERPINC1P01008 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SERPINC1P01008 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SERPINC1P01008 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SERPINC1P01008 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SERPINC1P01008 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SERPINC1P01008 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SERPINC1P01008 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SERPINC1P01008 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SERPINC1P01008 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SERPINC1P01008 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SERPINC1P01008 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SERPINC1P01008 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SERPINC1P01008 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SERPINC1P01008 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SERPINC1P01008 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SERPINC1P01008 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SERPINC1P01008 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SERPINC1P01008 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SERPINC1P01008 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SERPINC1P01008 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SERPINC1P01008 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SERPINC1P01008 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SERPINC1P01008 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SERPINC1P01008 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SERPINC1P01008 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SERPINC1P01008 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SERPINC1P01008 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SERPINC1P01008 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SERPINC1P01008 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SERPINC1P01008 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SERPINC1P01008 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SERPINC1P01008 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SERPINC1P01008 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SERPINC1P01008 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SERPINC1P01008 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SERPINC1P01008 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SERPINC1P01008 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SERPINC1P01008 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SERPINC1P01008 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SERPINC1P01008 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SERPINC1P01008 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SERPINC1P01008 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SERPINC1P01008 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SERPINC1P01008 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SERPINC1P01008 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SERPINC1P01008 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SERPINC1P01008 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SERPINC1P01008 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SERPINC1P01008 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SERPINC1P01008 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SERPINC1P01008 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SERPINC1P01008 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SERPINC1P01008 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SERPINC1P01008 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SERPINC1P01008 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SERPINC1P01008 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SERPINC1P01008 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SERPINC1P01008 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SERPINC1P01008 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SERPINC1P01008 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SERPINC1P01008 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SERPINC1P01008 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SERPINC1P01008 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SERPINC1P01008 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SERPINC1P01008 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SERPINC1P01008 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms