Protein–RNA interactions for Protein: O95497

VNN1, Pantetheinase, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN1O95497 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VNN1O95497 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VNN1O95497 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VNN1O95497 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VNN1O95497 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VNN1O95497 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
VNN1O95497 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VNN1O95497 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VNN1O95497 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VNN1O95497 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VNN1O95497 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VNN1O95497 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
VNN1O95497 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VNN1O95497 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VNN1O95497 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VNN1O95497 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VNN1O95497 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VNN1O95497 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VNN1O95497 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VNN1O95497 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VNN1O95497 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VNN1O95497 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VNN1O95497 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VNN1O95497 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VNN1O95497 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VNN1O95497 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VNN1O95497 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VNN1O95497 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VNN1O95497 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VNN1O95497 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VNN1O95497 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VNN1O95497 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VNN1O95497 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VNN1O95497 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VNN1O95497 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VNN1O95497 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VNN1O95497 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VNN1O95497 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VNN1O95497 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VNN1O95497 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VNN1O95497 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
VNN1O95497 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
VNN1O95497 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VNN1O95497 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VNN1O95497 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VNN1O95497 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VNN1O95497 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VNN1O95497 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VNN1O95497 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VNN1O95497 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VNN1O95497 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VNN1O95497 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VNN1O95497 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VNN1O95497 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VNN1O95497 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VNN1O95497 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VNN1O95497 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VNN1O95497 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VNN1O95497 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VNN1O95497 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VNN1O95497 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
VNN1O95497 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
VNN1O95497 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VNN1O95497 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VNN1O95497 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VNN1O95497 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VNN1O95497 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VNN1O95497 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VNN1O95497 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VNN1O95497 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VNN1O95497 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VNN1O95497 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VNN1O95497 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VNN1O95497 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VNN1O95497 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VNN1O95497 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VNN1O95497 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VNN1O95497 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VNN1O95497 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VNN1O95497 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VNN1O95497 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VNN1O95497 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VNN1O95497 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VNN1O95497 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
VNN1O95497 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VNN1O95497 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VNN1O95497 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VNN1O95497 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VNN1O95497 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
VNN1O95497 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VNN1O95497 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VNN1O95497 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VNN1O95497 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VNN1O95497 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
VNN1O95497 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VNN1O95497 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VNN1O95497 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VNN1O95497 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VNN1O95497 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VNN1O95497 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms