Protein–RNA interactions for Protein: O95379

TNFAIP8, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8O95379 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFAIP8O95379 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFAIP8O95379 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFAIP8O95379 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFAIP8O95379 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFAIP8O95379 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFAIP8O95379 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFAIP8O95379 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFAIP8O95379 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFAIP8O95379 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFAIP8O95379 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFAIP8O95379 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFAIP8O95379 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFAIP8O95379 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFAIP8O95379 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFAIP8O95379 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFAIP8O95379 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFAIP8O95379 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFAIP8O95379 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFAIP8O95379 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFAIP8O95379 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFAIP8O95379 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFAIP8O95379 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFAIP8O95379 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFAIP8O95379 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFAIP8O95379 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFAIP8O95379 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFAIP8O95379 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFAIP8O95379 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFAIP8O95379 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFAIP8O95379 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFAIP8O95379 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFAIP8O95379 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFAIP8O95379 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFAIP8O95379 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFAIP8O95379 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFAIP8O95379 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFAIP8O95379 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFAIP8O95379 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFAIP8O95379 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFAIP8O95379 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFAIP8O95379 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFAIP8O95379 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFAIP8O95379 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFAIP8O95379 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFAIP8O95379 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFAIP8O95379 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFAIP8O95379 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFAIP8O95379 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFAIP8O95379 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFAIP8O95379 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFAIP8O95379 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFAIP8O95379 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFAIP8O95379 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFAIP8O95379 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFAIP8O95379 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFAIP8O95379 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFAIP8O95379 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFAIP8O95379 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFAIP8O95379 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFAIP8O95379 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFAIP8O95379 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFAIP8O95379 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFAIP8O95379 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFAIP8O95379 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFAIP8O95379 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFAIP8O95379 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFAIP8O95379 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFAIP8O95379 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFAIP8O95379 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNFAIP8O95379 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFAIP8O95379 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFAIP8O95379 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFAIP8O95379 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFAIP8O95379 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP8O95379 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP8O95379 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP8O95379 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP8O95379 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP8O95379 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFAIP8O95379 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFAIP8O95379 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFAIP8O95379 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFAIP8O95379 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFAIP8O95379 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFAIP8O95379 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFAIP8O95379 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFAIP8O95379 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFAIP8O95379 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFAIP8O95379 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFAIP8O95379 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFAIP8O95379 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFAIP8O95379 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFAIP8O95379 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNFAIP8O95379 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFAIP8O95379 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFAIP8O95379 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFAIP8O95379 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFAIP8O95379 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFAIP8O95379 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms