Protein–RNA interactions for Protein: O95164

UBL3, Ubiquitin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL3O95164 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBL3O95164 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBL3O95164 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UBL3O95164 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBL3O95164 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBL3O95164 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBL3O95164 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBL3O95164 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBL3O95164 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBL3O95164 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBL3O95164 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBL3O95164 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBL3O95164 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBL3O95164 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBL3O95164 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBL3O95164 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBL3O95164 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBL3O95164 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UBL3O95164 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBL3O95164 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBL3O95164 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBL3O95164 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBL3O95164 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBL3O95164 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UBL3O95164 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBL3O95164 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBL3O95164 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBL3O95164 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBL3O95164 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBL3O95164 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBL3O95164 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBL3O95164 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBL3O95164 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBL3O95164 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBL3O95164 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBL3O95164 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBL3O95164 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBL3O95164 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBL3O95164 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBL3O95164 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBL3O95164 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBL3O95164 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBL3O95164 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBL3O95164 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBL3O95164 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBL3O95164 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBL3O95164 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBL3O95164 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBL3O95164 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBL3O95164 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBL3O95164 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBL3O95164 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBL3O95164 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBL3O95164 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBL3O95164 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBL3O95164 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBL3O95164 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBL3O95164 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBL3O95164 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBL3O95164 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBL3O95164 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBL3O95164 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBL3O95164 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBL3O95164 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBL3O95164 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBL3O95164 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBL3O95164 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBL3O95164 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBL3O95164 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBL3O95164 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBL3O95164 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBL3O95164 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBL3O95164 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBL3O95164 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBL3O95164 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBL3O95164 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBL3O95164 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBL3O95164 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBL3O95164 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBL3O95164 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBL3O95164 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBL3O95164 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBL3O95164 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBL3O95164 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBL3O95164 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBL3O95164 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBL3O95164 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBL3O95164 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBL3O95164 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBL3O95164 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBL3O95164 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBL3O95164 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBL3O95164 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBL3O95164 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBL3O95164 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UBL3O95164 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBL3O95164 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBL3O95164 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBL3O95164 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBL3O95164 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms