Protein–RNA interactions for Protein: O76031

CLPX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPXO76031 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLPXO76031 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLPXO76031 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLPXO76031 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLPXO76031 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLPXO76031 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLPXO76031 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLPXO76031 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLPXO76031 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLPXO76031 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLPXO76031 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLPXO76031 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLPXO76031 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLPXO76031 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLPXO76031 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLPXO76031 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLPXO76031 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLPXO76031 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLPXO76031 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLPXO76031 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLPXO76031 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLPXO76031 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLPXO76031 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLPXO76031 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLPXO76031 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLPXO76031 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLPXO76031 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLPXO76031 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLPXO76031 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLPXO76031 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLPXO76031 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLPXO76031 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLPXO76031 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLPXO76031 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLPXO76031 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLPXO76031 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLPXO76031 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLPXO76031 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLPXO76031 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLPXO76031 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLPXO76031 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLPXO76031 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLPXO76031 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLPXO76031 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLPXO76031 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLPXO76031 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLPXO76031 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLPXO76031 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLPXO76031 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLPXO76031 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLPXO76031 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLPXO76031 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPXO76031 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPXO76031 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPXO76031 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPXO76031 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPXO76031 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPXO76031 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPXO76031 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPXO76031 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPXO76031 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPXO76031 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPXO76031 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPXO76031 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPXO76031 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPXO76031 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPXO76031 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPXO76031 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPXO76031 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPXO76031 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPXO76031 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPXO76031 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPXO76031 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPXO76031 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPXO76031 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPXO76031 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPXO76031 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPXO76031 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPXO76031 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPXO76031 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPXO76031 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPXO76031 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPXO76031 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPXO76031 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPXO76031 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPXO76031 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPXO76031 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLPXO76031 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLPXO76031 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLPXO76031 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPXO76031 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPXO76031 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPXO76031 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPXO76031 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPXO76031 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPXO76031 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPXO76031 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPXO76031 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPXO76031 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPXO76031 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms