Protein–RNA interactions for Protein: O75879

GATB, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATBO75879 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATBO75879 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATBO75879 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATBO75879 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATBO75879 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATBO75879 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATBO75879 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATBO75879 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATBO75879 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GATBO75879 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATBO75879 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATBO75879 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATBO75879 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATBO75879 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATBO75879 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GATBO75879 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GATBO75879 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GATBO75879 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATBO75879 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATBO75879 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GATBO75879 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GATBO75879 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATBO75879 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATBO75879 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATBO75879 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GATBO75879 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GATBO75879 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GATBO75879 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GATBO75879 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATBO75879 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATBO75879 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATBO75879 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATBO75879 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATBO75879 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATBO75879 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GATBO75879 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATBO75879 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATBO75879 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATBO75879 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GATBO75879 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GATBO75879 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GATBO75879 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATBO75879 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATBO75879 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GATBO75879 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GATBO75879 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GATBO75879 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATBO75879 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATBO75879 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATBO75879 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATBO75879 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATBO75879 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GATBO75879 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATBO75879 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATBO75879 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GATBO75879 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GATBO75879 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GATBO75879 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GATBO75879 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATBO75879 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GATBO75879 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATBO75879 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATBO75879 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATBO75879 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATBO75879 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATBO75879 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATBO75879 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATBO75879 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATBO75879 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATBO75879 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GATBO75879 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATBO75879 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATBO75879 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATBO75879 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATBO75879 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATBO75879 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATBO75879 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATBO75879 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GATBO75879 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GATBO75879 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GATBO75879 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GATBO75879 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATBO75879 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATBO75879 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATBO75879 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATBO75879 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATBO75879 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATBO75879 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATBO75879 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATBO75879 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATBO75879 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATBO75879 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATBO75879 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATBO75879 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATBO75879 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATBO75879 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATBO75879 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATBO75879 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATBO75879 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATBO75879 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms