Protein–RNA interactions for Protein: O75575

CRCP, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRCPO75575 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRCPO75575 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRCPO75575 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRCPO75575 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRCPO75575 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CRCPO75575 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRCPO75575 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRCPO75575 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRCPO75575 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRCPO75575 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRCPO75575 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRCPO75575 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRCPO75575 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRCPO75575 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRCPO75575 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRCPO75575 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRCPO75575 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRCPO75575 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRCPO75575 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRCPO75575 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRCPO75575 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRCPO75575 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRCPO75575 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRCPO75575 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRCPO75575 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRCPO75575 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRCPO75575 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRCPO75575 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRCPO75575 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRCPO75575 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRCPO75575 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRCPO75575 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRCPO75575 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRCPO75575 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CRCPO75575 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRCPO75575 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRCPO75575 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CRCPO75575 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRCPO75575 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRCPO75575 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CRCPO75575 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRCPO75575 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRCPO75575 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRCPO75575 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRCPO75575 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRCPO75575 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRCPO75575 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRCPO75575 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRCPO75575 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRCPO75575 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRCPO75575 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRCPO75575 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRCPO75575 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRCPO75575 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRCPO75575 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRCPO75575 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRCPO75575 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRCPO75575 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CRCPO75575 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRCPO75575 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRCPO75575 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRCPO75575 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRCPO75575 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRCPO75575 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRCPO75575 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRCPO75575 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRCPO75575 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRCPO75575 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRCPO75575 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRCPO75575 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRCPO75575 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRCPO75575 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRCPO75575 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRCPO75575 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRCPO75575 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRCPO75575 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRCPO75575 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CRCPO75575 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CRCPO75575 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRCPO75575 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRCPO75575 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRCPO75575 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRCPO75575 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRCPO75575 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRCPO75575 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRCPO75575 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRCPO75575 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRCPO75575 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRCPO75575 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRCPO75575 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRCPO75575 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRCPO75575 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRCPO75575 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRCPO75575 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRCPO75575 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRCPO75575 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRCPO75575 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRCPO75575 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRCPO75575 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRCPO75575 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms