Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF10O60809 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF10O60809 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF10O60809 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF10O60809 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF10O60809 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF10O60809 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF10O60809 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF10O60809 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF10O60809 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF10O60809 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF10O60809 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF10O60809 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF10O60809 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF10O60809 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRAMEF10O60809 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF10O60809 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF10O60809 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF10O60809 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF10O60809 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF10O60809 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF10O60809 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF10O60809 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF10O60809 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF10O60809 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF10O60809 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF10O60809 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF10O60809 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF10O60809 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF10O60809 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF10O60809 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF10O60809 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF10O60809 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF10O60809 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF10O60809 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF10O60809 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF10O60809 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF10O60809 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF10O60809 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF10O60809 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF10O60809 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF10O60809 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF10O60809 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF10O60809 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF10O60809 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF10O60809 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF10O60809 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF10O60809 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF10O60809 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF10O60809 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF10O60809 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF10O60809 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF10O60809 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF10O60809 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRAMEF10O60809 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF10O60809 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF10O60809 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF10O60809 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF10O60809 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF10O60809 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF10O60809 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF10O60809 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF10O60809 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF10O60809 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF10O60809 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF10O60809 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF10O60809 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF10O60809 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF10O60809 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF10O60809 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF10O60809 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF10O60809 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF10O60809 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF10O60809 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF10O60809 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF10O60809 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF10O60809 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF10O60809 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF10O60809 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF10O60809 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PRAMEF10O60809 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRAMEF10O60809 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRAMEF10O60809 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRAMEF10O60809 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF10O60809 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF10O60809 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF10O60809 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF10O60809 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF10O60809 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF10O60809 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF10O60809 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF10O60809 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF10O60809 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF10O60809 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF10O60809 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF10O60809 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF10O60809 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF10O60809 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF10O60809 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF10O60809 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms