Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOFO60613 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SELENOFO60613 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SELENOFO60613 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SELENOFO60613 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SELENOFO60613 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SELENOFO60613 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SELENOFO60613 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SELENOFO60613 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SELENOFO60613 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SELENOFO60613 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SELENOFO60613 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SELENOFO60613 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENOFO60613 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOFO60613 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOFO60613 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENOFO60613 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENOFO60613 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENOFO60613 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SELENOFO60613 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SELENOFO60613 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SELENOFO60613 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SELENOFO60613 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SELENOFO60613 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SELENOFO60613 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SELENOFO60613 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SELENOFO60613 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SELENOFO60613 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SELENOFO60613 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SELENOFO60613 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SELENOFO60613 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SELENOFO60613 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SELENOFO60613 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SELENOFO60613 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SELENOFO60613 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SELENOFO60613 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SELENOFO60613 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SELENOFO60613 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SELENOFO60613 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SELENOFO60613 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SELENOFO60613 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SELENOFO60613 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SELENOFO60613 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SELENOFO60613 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOFO60613 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOFO60613 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SELENOFO60613 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOFO60613 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOFO60613 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOFO60613 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms