Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
ATP10AO60312 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
ATP10AO60312 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
ATP10AO60312 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ATP10AO60312 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ATP10AO60312 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ATP10AO60312 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ATP10AO60312 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ATP10AO60312 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ATP10AO60312 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ATP10AO60312 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ATP10AO60312 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
ATP10AO60312 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC40.29■■■■■ 4.04
ATP10AO60312 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
ATP10AO60312 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
ATP10AO60312 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
ATP10AO60312 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.03
ATP10AO60312 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ATP10AO60312 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
ATP10AO60312 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
ATP10AO60312 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ATP10AO60312 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
ATP10AO60312 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ATP10AO60312 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
ATP10AO60312 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ATP10AO60312 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ATP10AO60312 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ATP10AO60312 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
ATP10AO60312 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
ATP10AO60312 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
ATP10AO60312 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC40.17■■■■■ 4.02
ATP10AO60312 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
ATP10AO60312 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
ATP10AO60312 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
ATP10AO60312 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
ATP10AO60312 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
ATP10AO60312 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
ATP10AO60312 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ATP10AO60312 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
ATP10AO60312 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ATP10AO60312 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
ATP10AO60312 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ATP10AO60312 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
ATP10AO60312 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
ATP10AO60312 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
ATP10AO60312 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
ATP10AO60312 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
ATP10AO60312 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
ATP10AO60312 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
ATP10AO60312 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
ATP10AO60312 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC40.05■■■■■ 4
ATP10AO60312 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
ATP10AO60312 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
ATP10AO60312 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
ATP10AO60312 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
ATP10AO60312 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
ATP10AO60312 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
ATP10AO60312 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
ATP10AO60312 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
ATP10AO60312 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
ATP10AO60312 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
ATP10AO60312 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
ATP10AO60312 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
ATP10AO60312 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
ATP10AO60312 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
ATP10AO60312 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
ATP10AO60312 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
ATP10AO60312 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
ATP10AO60312 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
ATP10AO60312 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
ATP10AO60312 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
ATP10AO60312 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
ATP10AO60312 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
ATP10AO60312 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
ATP10AO60312 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC39.86■■■■□ 3.97
ATP10AO60312 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
ATP10AO60312 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC39.84■■■■□ 3.97
ATP10AO60312 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
ATP10AO60312 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
ATP10AO60312 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
ATP10AO60312 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
ATP10AO60312 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.81■■■■□ 3.96
ATP10AO60312 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
ATP10AO60312 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
ATP10AO60312 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
ATP10AO60312 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
ATP10AO60312 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
ATP10AO60312 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
ATP10AO60312 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
ATP10AO60312 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
ATP10AO60312 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
ATP10AO60312 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.74■■■■□ 3.95
ATP10AO60312 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
ATP10AO60312 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
ATP10AO60312 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
ATP10AO60312 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
ATP10AO60312 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
ATP10AO60312 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
ATP10AO60312 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
ATP10AO60312 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms