Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRAK2O60296 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
TRAK2O60296 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRAK2O60296 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRAK2O60296 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRAK2O60296 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRAK2O60296 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TRAK2O60296 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TRAK2O60296 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRAK2O60296 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
TRAK2O60296 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TRAK2O60296 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TRAK2O60296 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRAK2O60296 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRAK2O60296 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRAK2O60296 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRAK2O60296 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRAK2O60296 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
TRAK2O60296 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRAK2O60296 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRAK2O60296 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRAK2O60296 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRAK2O60296 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRAK2O60296 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TRAK2O60296 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TRAK2O60296 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TRAK2O60296 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TRAK2O60296 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TRAK2O60296 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TRAK2O60296 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TRAK2O60296 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TRAK2O60296 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TRAK2O60296 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TRAK2O60296 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRAK2O60296 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRAK2O60296 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRAK2O60296 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRAK2O60296 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRAK2O60296 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRAK2O60296 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
TRAK2O60296 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TRAK2O60296 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRAK2O60296 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRAK2O60296 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRAK2O60296 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TRAK2O60296 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRAK2O60296 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAK2O60296 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAK2O60296 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRAK2O60296 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRAK2O60296 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRAK2O60296 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRAK2O60296 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRAK2O60296 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRAK2O60296 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRAK2O60296 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAK2O60296 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAK2O60296 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAK2O60296 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAK2O60296 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAK2O60296 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAK2O60296 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAK2O60296 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAK2O60296 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAK2O60296 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAK2O60296 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAK2O60296 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAK2O60296 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRAK2O60296 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAK2O60296 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAK2O60296 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAK2O60296 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAK2O60296 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAK2O60296 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAK2O60296 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAK2O60296 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAK2O60296 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAK2O60296 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAK2O60296 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAK2O60296 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAK2O60296 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAK2O60296 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAK2O60296 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAK2O60296 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TRAK2O60296 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TRAK2O60296 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRAK2O60296 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
TRAK2O60296 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAK2O60296 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAK2O60296 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAK2O60296 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAK2O60296 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAK2O60296 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAK2O60296 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRAK2O60296 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRAK2O60296 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRAK2O60296 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRAK2O60296 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRAK2O60296 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRAK2O60296 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms