Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
SPAG9O60271 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
SPAG9O60271 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
SPAG9O60271 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
SPAG9O60271 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
SPAG9O60271 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
SPAG9O60271 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SPAG9O60271 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
SPAG9O60271 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
SPAG9O60271 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
SPAG9O60271 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
SPAG9O60271 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SPAG9O60271 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
SPAG9O60271 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
SPAG9O60271 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
SPAG9O60271 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
SPAG9O60271 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SPAG9O60271 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC40.15■■■■■ 4.02
SPAG9O60271 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SPAG9O60271 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SPAG9O60271 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
SPAG9O60271 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
SPAG9O60271 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
SPAG9O60271 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
SPAG9O60271 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
SPAG9O60271 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
SPAG9O60271 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
SPAG9O60271 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
SPAG9O60271 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
SPAG9O60271 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
SPAG9O60271 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
SPAG9O60271 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
SPAG9O60271 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
SPAG9O60271 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
SPAG9O60271 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
SPAG9O60271 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
SPAG9O60271 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
SPAG9O60271 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
SPAG9O60271 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
SPAG9O60271 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
SPAG9O60271 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
SPAG9O60271 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
SPAG9O60271 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.01■■■■□ 3.99
SPAG9O60271 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40■■■■□ 3.99
SPAG9O60271 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
SPAG9O60271 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SPAG9O60271 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SPAG9O60271 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SPAG9O60271 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SPAG9O60271 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SPAG9O60271 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SPAG9O60271 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SPAG9O60271 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SPAG9O60271 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SPAG9O60271 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
SPAG9O60271 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
SPAG9O60271 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
SPAG9O60271 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC39.95■■■■□ 3.99
SPAG9O60271 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.95■■■■□ 3.99
SPAG9O60271 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
SPAG9O60271 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
SPAG9O60271 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
SPAG9O60271 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
SPAG9O60271 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
SPAG9O60271 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
SPAG9O60271 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
SPAG9O60271 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
SPAG9O60271 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
SPAG9O60271 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
SPAG9O60271 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
SPAG9O60271 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
SPAG9O60271 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
SPAG9O60271 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
SPAG9O60271 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
SPAG9O60271 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
SPAG9O60271 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
SPAG9O60271 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
SPAG9O60271 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
SPAG9O60271 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.96
SPAG9O60271 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC39.82■■■■□ 3.96
SPAG9O60271 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
SPAG9O60271 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
SPAG9O60271 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
SPAG9O60271 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
SPAG9O60271 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
SPAG9O60271 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
SPAG9O60271 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
SPAG9O60271 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
SPAG9O60271 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
SPAG9O60271 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
SPAG9O60271 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
SPAG9O60271 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
SPAG9O60271 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
SPAG9O60271 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
SPAG9O60271 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
SPAG9O60271 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
SPAG9O60271 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
SPAG9O60271 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
SPAG9O60271 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
SPAG9O60271 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms