Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SH3BP5O60239 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SH3BP5O60239 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SH3BP5O60239 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SH3BP5O60239 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH3BP5O60239 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH3BP5O60239 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH3BP5O60239 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH3BP5O60239 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH3BP5O60239 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH3BP5O60239 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH3BP5O60239 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH3BP5O60239 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH3BP5O60239 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH3BP5O60239 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH3BP5O60239 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH3BP5O60239 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH3BP5O60239 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH3BP5O60239 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH3BP5O60239 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH3BP5O60239 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH3BP5O60239 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3BP5O60239 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3BP5O60239 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3BP5O60239 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3BP5O60239 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH3BP5O60239 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH3BP5O60239 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH3BP5O60239 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH3BP5O60239 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH3BP5O60239 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3BP5O60239 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH3BP5O60239 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH3BP5O60239 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH3BP5O60239 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH3BP5O60239 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3BP5O60239 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3BP5O60239 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3BP5O60239 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3BP5O60239 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3BP5O60239 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3BP5O60239 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH3BP5O60239 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH3BP5O60239 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH3BP5O60239 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH3BP5O60239 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH3BP5O60239 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH3BP5O60239 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH3BP5O60239 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH3BP5O60239 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH3BP5O60239 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH3BP5O60239 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH3BP5O60239 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH3BP5O60239 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH3BP5O60239 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH3BP5O60239 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH3BP5O60239 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SH3BP5O60239 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH3BP5O60239 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH3BP5O60239 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH3BP5O60239 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH3BP5O60239 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH3BP5O60239 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH3BP5O60239 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH3BP5O60239 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH3BP5O60239 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH3BP5O60239 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH3BP5O60239 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH3BP5O60239 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH3BP5O60239 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH3BP5O60239 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH3BP5O60239 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH3BP5O60239 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH3BP5O60239 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH3BP5O60239 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3BP5O60239 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms