Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms