Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAP3K13O43283 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K13O43283 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K13O43283 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K13O43283 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K13O43283 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K13O43283 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K13O43283 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K13O43283 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAP3K13O43283 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAP3K13O43283 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAP3K13O43283 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAP3K13O43283 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAP3K13O43283 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAP3K13O43283 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K13O43283 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K13O43283 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K13O43283 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K13O43283 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K13O43283 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K13O43283 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K13O43283 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K13O43283 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K13O43283 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K13O43283 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K13O43283 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K13O43283 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K13O43283 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K13O43283 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAP3K13O43283 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K13O43283 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K13O43283 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K13O43283 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K13O43283 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAP3K13O43283 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K13O43283 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K13O43283 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAP3K13O43283 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K13O43283 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAP3K13O43283 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAP3K13O43283 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K13O43283 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K13O43283 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K13O43283 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K13O43283 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K13O43283 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K13O43283 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K13O43283 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAP3K13O43283 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAP3K13O43283 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAP3K13O43283 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAP3K13O43283 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAP3K13O43283 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MAP3K13O43283 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAP3K13O43283 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAP3K13O43283 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAP3K13O43283 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAP3K13O43283 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAP3K13O43283 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAP3K13O43283 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAP3K13O43283 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MAP3K13O43283 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAP3K13O43283 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K13O43283 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K13O43283 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MAP3K13O43283 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MAP3K13O43283 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MAP3K13O43283 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MAP3K13O43283 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAP3K13O43283 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAP3K13O43283 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP3K13O43283 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP3K13O43283 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP3K13O43283 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP3K13O43283 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP3K13O43283 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP3K13O43283 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP3K13O43283 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP3K13O43283 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP3K13O43283 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP3K13O43283 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP3K13O43283 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAP3K13O43283 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAP3K13O43283 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAP3K13O43283 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAP3K13O43283 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MAP3K13O43283 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MAP3K13O43283 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MAP3K13O43283 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MAP3K13O43283 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MAP3K13O43283 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MAP3K13O43283 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MAP3K13O43283 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MAP3K13O43283 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MAP3K13O43283 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MAP3K13O43283 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MAP3K13O43283 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MAP3K13O43283 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MAP3K13O43283 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MAP3K13O43283 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms