Protein–RNA interactions for Protein: O15498

YKT6, Synaptobrevin homolog YKT6, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YKT6O15498 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
YKT6O15498 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
YKT6O15498 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
YKT6O15498 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
YKT6O15498 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
YKT6O15498 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YKT6O15498 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YKT6O15498 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YKT6O15498 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YKT6O15498 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YKT6O15498 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YKT6O15498 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YKT6O15498 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YKT6O15498 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
YKT6O15498 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
YKT6O15498 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
YKT6O15498 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
YKT6O15498 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YKT6O15498 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YKT6O15498 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YKT6O15498 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YKT6O15498 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YKT6O15498 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
YKT6O15498 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YKT6O15498 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YKT6O15498 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
YKT6O15498 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
YKT6O15498 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
YKT6O15498 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YKT6O15498 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YKT6O15498 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YKT6O15498 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YKT6O15498 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YKT6O15498 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YKT6O15498 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YKT6O15498 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YKT6O15498 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YKT6O15498 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YKT6O15498 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YKT6O15498 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YKT6O15498 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YKT6O15498 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YKT6O15498 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YKT6O15498 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YKT6O15498 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YKT6O15498 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YKT6O15498 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YKT6O15498 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YKT6O15498 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YKT6O15498 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YKT6O15498 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YKT6O15498 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YKT6O15498 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YKT6O15498 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YKT6O15498 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YKT6O15498 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YKT6O15498 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YKT6O15498 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YKT6O15498 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YKT6O15498 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YKT6O15498 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YKT6O15498 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YKT6O15498 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YKT6O15498 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
YKT6O15498 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
YKT6O15498 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
YKT6O15498 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
YKT6O15498 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YKT6O15498 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YKT6O15498 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YKT6O15498 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YKT6O15498 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YKT6O15498 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YKT6O15498 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YKT6O15498 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YKT6O15498 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YKT6O15498 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YKT6O15498 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YKT6O15498 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YKT6O15498 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YKT6O15498 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
YKT6O15498 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YKT6O15498 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
YKT6O15498 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
YKT6O15498 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
YKT6O15498 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
YKT6O15498 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YKT6O15498 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
YKT6O15498 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
YKT6O15498 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
YKT6O15498 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
YKT6O15498 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
YKT6O15498 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
YKT6O15498 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
YKT6O15498 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
YKT6O15498 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
YKT6O15498 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YKT6O15498 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YKT6O15498 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YKT6O15498 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms