Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CITO14578 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CITO14578 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CITO14578 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CITO14578 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CITO14578 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CITO14578 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CITO14578 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CITO14578 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CITO14578 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CITO14578 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CITO14578 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CITO14578 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CITO14578 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CITO14578 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CITO14578 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CITO14578 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CITO14578 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CITO14578 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CITO14578 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CITO14578 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CITO14578 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CITO14578 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CITO14578 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CITO14578 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CITO14578 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CITO14578 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CITO14578 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CITO14578 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CITO14578 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CITO14578 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CITO14578 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CITO14578 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CITO14578 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CITO14578 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CITO14578 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CITO14578 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CITO14578 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CITO14578 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CITO14578 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CITO14578 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CITO14578 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CITO14578 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CITO14578 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CITO14578 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CITO14578 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CITO14578 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CITO14578 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CITO14578 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CITO14578 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CITO14578 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CITO14578 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CITO14578 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CITO14578 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CITO14578 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CITO14578 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CITO14578 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CITO14578 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CITO14578 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CITO14578 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CITO14578 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CITO14578 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CITO14578 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CITO14578 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CITO14578 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CITO14578 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CITO14578 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CITO14578 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CITO14578 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CITO14578 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CITO14578 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CITO14578 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CITO14578 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CITO14578 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CITO14578 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CITO14578 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CITO14578 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CITO14578 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CITO14578 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CITO14578 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CITO14578 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CITO14578 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CITO14578 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CITO14578 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CITO14578 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CITO14578 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CITO14578 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CITO14578 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CITO14578 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CITO14578 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CITO14578 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CITO14578 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CITO14578 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CITO14578 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CITO14578 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CITO14578 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CITO14578 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CITO14578 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CITO14578 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CITO14578 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms