Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PIK3C2AO00443 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PIK3C2AO00443 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PIK3C2AO00443 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PIK3C2AO00443 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PIK3C2AO00443 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PIK3C2AO00443 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PIK3C2AO00443 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
PIK3C2AO00443 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PIK3C2AO00443 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PIK3C2AO00443 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PIK3C2AO00443 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PIK3C2AO00443 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PIK3C2AO00443 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PIK3C2AO00443 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PIK3C2AO00443 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PIK3C2AO00443 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PIK3C2AO00443 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
PIK3C2AO00443 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
PIK3C2AO00443 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
PIK3C2AO00443 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
PIK3C2AO00443 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PIK3C2AO00443 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PIK3C2AO00443 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PIK3C2AO00443 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PIK3C2AO00443 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PIK3C2AO00443 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PIK3C2AO00443 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PIK3C2AO00443 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PIK3C2AO00443 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PIK3C2AO00443 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PIK3C2AO00443 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PIK3C2AO00443 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PIK3C2AO00443 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PIK3C2AO00443 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PIK3C2AO00443 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PIK3C2AO00443 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PIK3C2AO00443 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PIK3C2AO00443 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PIK3C2AO00443 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PIK3C2AO00443 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PIK3C2AO00443 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PIK3C2AO00443 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PIK3C2AO00443 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PIK3C2AO00443 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PIK3C2AO00443 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PIK3C2AO00443 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PIK3C2AO00443 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PIK3C2AO00443 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PIK3C2AO00443 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PIK3C2AO00443 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PIK3C2AO00443 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
PIK3C2AO00443 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PIK3C2AO00443 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PIK3C2AO00443 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PIK3C2AO00443 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PIK3C2AO00443 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PIK3C2AO00443 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PIK3C2AO00443 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PIK3C2AO00443 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PIK3C2AO00443 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PIK3C2AO00443 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PIK3C2AO00443 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PIK3C2AO00443 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PIK3C2AO00443 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PIK3C2AO00443 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PIK3C2AO00443 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PIK3C2AO00443 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PIK3C2AO00443 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PIK3C2AO00443 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PIK3C2AO00443 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
PIK3C2AO00443 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PIK3C2AO00443 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PIK3C2AO00443 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PIK3C2AO00443 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
PIK3C2AO00443 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PIK3C2AO00443 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
PIK3C2AO00443 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PIK3C2AO00443 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PIK3C2AO00443 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PIK3C2AO00443 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
PIK3C2AO00443 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PIK3C2AO00443 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PIK3C2AO00443 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PIK3C2AO00443 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PIK3C2AO00443 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PIK3C2AO00443 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PIK3C2AO00443 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PIK3C2AO00443 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PIK3C2AO00443 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PIK3C2AO00443 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PIK3C2AO00443 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PIK3C2AO00443 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PIK3C2AO00443 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PIK3C2AO00443 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PIK3C2AO00443 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PIK3C2AO00443 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PIK3C2AO00443 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PIK3C2AO00443 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PIK3C2AO00443 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms