Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP2O00295 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP2O00295 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TULP2O00295 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TULP2O00295 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP2O00295 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP2O00295 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP2O00295 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP2O00295 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP2O00295 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP2O00295 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TULP2O00295 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TULP2O00295 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TULP2O00295 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TULP2O00295 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TULP2O00295 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP2O00295 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP2O00295 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP2O00295 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TULP2O00295 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TULP2O00295 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TULP2O00295 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TULP2O00295 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TULP2O00295 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TULP2O00295 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TULP2O00295 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TULP2O00295 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TULP2O00295 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TULP2O00295 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TULP2O00295 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TULP2O00295 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TULP2O00295 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TULP2O00295 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TULP2O00295 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TULP2O00295 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TULP2O00295 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TULP2O00295 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TULP2O00295 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TULP2O00295 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TULP2O00295 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TULP2O00295 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TULP2O00295 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TULP2O00295 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP2O00295 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP2O00295 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TULP2O00295 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TULP2O00295 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TULP2O00295 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TULP2O00295 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TULP2O00295 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TULP2O00295 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TULP2O00295 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TULP2O00295 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TULP2O00295 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TULP2O00295 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TULP2O00295 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TULP2O00295 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP2O00295 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP2O00295 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP2O00295 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP2O00295 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TULP2O00295 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TULP2O00295 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TULP2O00295 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TULP2O00295 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
TULP2O00295 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TULP2O00295 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TULP2O00295 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TULP2O00295 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TULP2O00295 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TULP2O00295 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TULP2O00295 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TULP2O00295 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP2O00295 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP2O00295 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP2O00295 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP2O00295 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP2O00295 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TULP2O00295 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TULP2O00295 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TULP2O00295 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TULP2O00295 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TULP2O00295 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TULP2O00295 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TULP2O00295 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP2O00295 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP2O00295 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP2O00295 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP2O00295 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TULP2O00295 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TULP2O00295 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP2O00295 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP2O00295 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP2O00295 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TULP2O00295 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TULP2O00295 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TULP2O00295 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TULP2O00295 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TULP2O00295 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TULP2O00295 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms