Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TULP1O00294 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TULP1O00294 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TULP1O00294 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TULP1O00294 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TULP1O00294 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TULP1O00294 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TULP1O00294 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TULP1O00294 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TULP1O00294 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TULP1O00294 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TULP1O00294 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TULP1O00294 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TULP1O00294 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TULP1O00294 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TULP1O00294 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TULP1O00294 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TULP1O00294 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TULP1O00294 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TULP1O00294 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TULP1O00294 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TULP1O00294 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP1O00294 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP1O00294 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP1O00294 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP1O00294 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP1O00294 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP1O00294 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP1O00294 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP1O00294 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TULP1O00294 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TULP1O00294 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TULP1O00294 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TULP1O00294 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TULP1O00294 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TULP1O00294 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TULP1O00294 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TULP1O00294 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TULP1O00294 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TULP1O00294 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TULP1O00294 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TULP1O00294 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TULP1O00294 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TULP1O00294 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TULP1O00294 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TULP1O00294 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TULP1O00294 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TULP1O00294 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TULP1O00294 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TULP1O00294 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TULP1O00294 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TULP1O00294 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TULP1O00294 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TULP1O00294 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TULP1O00294 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TULP1O00294 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TULP1O00294 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TULP1O00294 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TULP1O00294 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TULP1O00294 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TULP1O00294 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TULP1O00294 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TULP1O00294 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TULP1O00294 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TULP1O00294 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TULP1O00294 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TULP1O00294 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TULP1O00294 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TULP1O00294 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TULP1O00294 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TULP1O00294 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TULP1O00294 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TULP1O00294 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TULP1O00294 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TULP1O00294 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TULP1O00294 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TULP1O00294 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TULP1O00294 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TULP1O00294 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TULP1O00294 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TULP1O00294 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TULP1O00294 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TULP1O00294 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TULP1O00294 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TULP1O00294 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TULP1O00294 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TULP1O00294 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TULP1O00294 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TULP1O00294 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TULP1O00294 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TULP1O00294 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TULP1O00294 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TULP1O00294 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TULP1O00294 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TULP1O00294 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TULP1O00294 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TULP1O00294 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TULP1O00294 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TULP1O00294 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TULP1O00294 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms