Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QR89 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QR89 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QR89 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QR89 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QR89 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QR89 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
J3QR89 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QR89 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QR89 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QR89 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QR89 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QR89 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QR89 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QR89 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QR89 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QR89 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QR89 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QR89 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QR89 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QR89 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QR89 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QR89 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QR89 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QR89 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QR89 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QR89 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QR89 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QR89 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QR89 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QR89 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QR89 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QR89 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QR89 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QR89 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QR89 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QR89 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QR89 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QR89 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QR89 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QR89 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QR89 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QR89 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QR89 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QR89 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QR89 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QR89 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QR89 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QR89 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QR89 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QR89 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QR89 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QR89 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QR89 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QR89 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QR89 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QR89 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QR89 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QR89 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QR89 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QR89 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QR89 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QR89 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QR89 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QR89 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QR89 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QR89 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QR89 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QR89 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QR89 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QR89 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QR89 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QR89 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QR89 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QR89 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QR89 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QR89 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR89 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR89 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR89 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR89 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR89 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR89 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QR89 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QR89 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QR89 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QR89 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QR89 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
J3QR89 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
J3QR89 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
J3QR89 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QR89 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QR89 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QR89 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QR89 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QR89 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QR89 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QR89 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QR89 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QR89 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms