Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QQQ9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QQQ9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QQQ9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QQQ9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QQQ9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QQQ9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QQQ9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QQQ9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QQQ9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QQQ9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QQQ9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QQQ9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QQQ9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QQQ9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QQQ9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QQQ9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QQQ9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
J3QQQ9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
J3QQQ9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QQQ9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QQQ9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QQQ9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QQQ9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QQQ9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QQQ9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QQQ9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QQQ9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QQQ9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QQQ9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QQQ9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QQQ9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QQQ9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QQQ9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QQQ9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QQQ9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QQQ9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QQQ9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QQQ9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QQQ9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
J3QQQ9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
J3QQQ9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
J3QQQ9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QQQ9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QQQ9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QQQ9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18■□□□□ 0.47
J3QQQ9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QQQ9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QQQ9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QQQ9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QQQ9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QQQ9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QQQ9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QQQ9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QQQ9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QQQ9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QQQ9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QQQ9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QQQ9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QQQ9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QQQ9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QQQ9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QQQ9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QQQ9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QQQ9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QQQ9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QQQ9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QQQ9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QQQ9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QQQ9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QQQ9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QQQ9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QQQ9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QQQ9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QQQ9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QQQ9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QQQ9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QQQ9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QQQ9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QQQ9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QQQ9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QQQ9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QQQ9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QQQ9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QQQ9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QQQ9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QQQ9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QQQ9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QQQ9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QQQ9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QQQ9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QQQ9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QQQ9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QQQ9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QQQ9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QQQ9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QQQ9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QQQ9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QQQ9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QQQ9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms