Protein–RNA interactions for Protein: J3KTA2

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KTA2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
J3KTA2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
J3KTA2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
J3KTA2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
J3KTA2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
J3KTA2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
J3KTA2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
J3KTA2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
J3KTA2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
J3KTA2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
J3KTA2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
J3KTA2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
J3KTA2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
J3KTA2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
J3KTA2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
J3KTA2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
J3KTA2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
J3KTA2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
J3KTA2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
J3KTA2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
J3KTA2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
J3KTA2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
J3KTA2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
J3KTA2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
J3KTA2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
J3KTA2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
J3KTA2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
J3KTA2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
J3KTA2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
J3KTA2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
J3KTA2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
J3KTA2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
J3KTA2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
J3KTA2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
J3KTA2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
J3KTA2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
J3KTA2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
J3KTA2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
J3KTA2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
J3KTA2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
J3KTA2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
J3KTA2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
J3KTA2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
J3KTA2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
J3KTA2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
J3KTA2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
J3KTA2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
J3KTA2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
J3KTA2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
J3KTA2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
J3KTA2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
J3KTA2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
J3KTA2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
J3KTA2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
J3KTA2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
J3KTA2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
J3KTA2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
J3KTA2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
J3KTA2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
J3KTA2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
J3KTA2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
J3KTA2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
J3KTA2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
J3KTA2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
J3KTA2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
J3KTA2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
J3KTA2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
J3KTA2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
J3KTA2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
J3KTA2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
J3KTA2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
J3KTA2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
J3KTA2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
J3KTA2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
J3KTA2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
J3KTA2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
J3KTA2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
J3KTA2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
J3KTA2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
J3KTA2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
J3KTA2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
J3KTA2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
J3KTA2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
J3KTA2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
J3KTA2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
J3KTA2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
J3KTA2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
J3KTA2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
J3KTA2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
J3KTA2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
J3KTA2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
J3KTA2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
J3KTA2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
J3KTA2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
J3KTA2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
J3KTA2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
J3KTA2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
J3KTA2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
J3KTA2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
J3KTA2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms